鱼源嗜水气单胞菌全菌蛋白双向电泳与质谱鉴定
Construction of two-dimensional(2-D) polyacrylamide gel electrophoresis and characterization of whole-cell proteins produced by the Aeromonas hydrophila from fish作者机构:天津农学院水产学院天津市水产生态及养殖重点实验室 河南师范大学水产学院
出 版 物:《水产学报》 (Journal of Fisheries of China)
年 卷 期:2016年第40卷第3期
页 面:379-387页
核心收录:
基 金:国家自然科学基金(31272692) 天津市应用基础与前沿技术研究重点项目(15JCZDJC34000) 河南省高校科技创新团队支持计划(15IRTSTHN018)~~
摘 要:为建立鱼源嗜水气单胞菌全菌蛋白图谱并进行质谱分析,利用双向电泳(2-DE)结合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF-MS)技术对嗜水气单胞菌的蛋白质组学进行鉴定研究。结果显示,嗜水气单胞菌28°C培养12 h、三氯醋酸(TCA)/丙酮沉淀法提取全菌蛋白、等电聚焦20 000 Vh的2-DE图谱匹配率达81%;采用18 cm、p H 3-10 IPG胶条进行2-DE分析获得146个蛋白点,随机选取部分蛋白点进行肽质量指纹图谱(PMF)分析,共鉴定23个蛋白点包括膜脂蛋白、分子伴侣、30S核糖体蛋白S1、延伸因子、细胞色素C等,其中发现烯醇化酶、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、二氢硫辛酰胺脱氢酶、精氨酸脱亚氨酶、ATP合酶α亚基、脱氧核糖核酸聚合酶亚基α、氨基甲酸激酶、腺苷酸激酶、尿苷磷酸化酶、硝基还原酶、肽酰脯氨酰异构酶共计11个代谢相关蛋白酶;基于分子功能进行蛋白分类(GO)分析,发现主要为结合(17.1%)、催化(14.3%)和转移酶(11.4%)等生物学过程。建立鱼源嗜水气单胞菌全菌蛋白图谱与部分蛋白鉴定,有助于理解嗜水气单胞菌的蛋白质组学及其分子机制。