群体遗传学模拟软件应用现状

作     者：高峰 李海鹏 Feng Gao;Haipeng Li

作者机构：中国科学院计算生物学重点实验室中国科学院-德国马普学会计算生物学伙伴研究所上海200031 中国科学院大学北京100049 

出 版 物：《遗传》 (Hereditas（Beijing))

年 卷 期：2016年第38卷第8期

页      面：707-717页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 1002[医学-临床医学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0835[工学-软件工程] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 081202[工学-计算机软件与理论] 0812[工学-计算机科学与技术（可授工学、理学学位）] 

基　　金：中国科学院先导B项目(编号:XDB13040800) 国家自然科学基金项目(编号:91531306)资助~~ 

主　　题：群体遗传学 计算机模拟 依时间向前 依时间向后 

摘      要：随着下一代测序技术的不断进步与测序价格的不断下降,越来越多物种的全基因组信息被公开。作为研究群体遗传变异模式工具之一的模拟软件必然将发挥越来越重要的作用。依据时间推演方向的不同,模拟软件可以分为依时间向前和向后推演,二者各有所长,功能上互相补充,分别适合于不同的模拟需求。这些软件在研究进化动力的影响、估计进化动力参数与验证不同进化假设以及新方法有效性等方面起着重要作用。本文简要介绍了群体遗传学相关理论知识,详细比较了近10年来发表的32款模拟软件,并对模拟软件的未来发展方向给出了建议。