浙江省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的遗传变异分析
Genetic analysis of porcine reproductive and respiratory syndrome virus ORF5 gene from Zhejiang province作者机构:浙江省农业科学院浙江杭州310021
出 版 物:《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)
年 卷 期:2013年第33卷第2期
页 面:187-194,200页
核心收录:
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
主 题:猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) ORF5基因 遗传变异
摘 要:为了解2004-2009年猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF5基因的变异情况,从浙江省各个地区采集了109份临床疑似病料,共检测到61份ORF5基因阳性,经序列测定得到可比序列117个。在核苷酸序列分析中,发现2004-2005年PRRSV ORF5序列之间同源性为83.6%~99.3%,2006年同源性最高达98.3~99.2%,2008-2009年同源性又有所降低。在氨基酸主要位点分析中,分离毒株的非中和表位27~30位点与美洲株相比,2004-2006年大部分毒株的29aa由A29-V29,而2007-2009年大部分毒株的29aa又由V29-A29;在表位37~45aa中,所有39位点处由L39-I39;在表位80~197aa中,从2004-2009年185aa大部分都发生了变异,由V185-A185,第189位点由I189-L189。在蛋白生化特性分析中,发现与参考株VR2332(AY150564)和CH-1a(AY032626)相比,浙江省PRRSV-GP5蛋白的第100~106位亲水性、表面可及性明显增加,抗原性指数也有所提高,而与参考毒株JX-06-2-EU480750相似。该试验结果说明随着时间的推移,PRRSV ORF5基因发生明显的变异。