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香蕉α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶基因家族全基因组鉴定与进化分析

Genome-wide Identification and Phylogenetic Analysis of α-1,4-glucan Starch Phosphorylase Gene Family of Banana

作     者:董晨 胡会刚 贾利强 决登伟 赵秋芳 陈宏良 DONG Chen;HU Hui-gang;JIA Li-qiang;JUE Deng-wei;ZHAO Qiu-fang;CHEN Hong-liang

作者机构:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树分子生物学重点实验室广东湛江524091 

出 版 物:《湖北农业科学》 (Hubei Agricultural Sciences)

年 卷 期:2016年第55卷第12期

页      面:3200-3204页

学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基  金:中央级公益性科研院所基本科研业务专项(1630062014010) 海南省自然科学基金项目(20153134) 

主  题:香蕉(Musa nana Lour.) α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶 生物信息 基因家族 进化分析 

摘      要:为了研究香蕉(Musa nana Lour.)α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶(α-1,4-glucan starch phosphorylase,PHS)基因家族的特征和功能,利用生物信息学方法对香蕉PHS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。结果表明,在香蕉中共鉴定出2个成员,Ma PHS1的开放阅读框长度为2 784 bp,编码927个氨基酸,分子质量为104.8 ku,等电点为6.59;Ma PHS2的开放阅读框长度为2 517 bp,编码838个氨基酸,分子质量为95.09 ku,等电点为6.09。Ma PHS1和Ma PHS2分别含有17个和15个外显子;Ma PHS1和Ma PHS2均含有淀粉磷酸化酶的保守性基序,进化过程中比较保守。

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