香蕉α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶基因家族全基因组鉴定与进化分析
Genome-wide Identification and Phylogenetic Analysis of α-1,4-glucan Starch Phosphorylase Gene Family of Banana作者机构:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树分子生物学重点实验室广东湛江524091
出 版 物:《湖北农业科学》 (Hubei Agricultural Sciences)
年 卷 期:2016年第55卷第12期
页 面:3200-3204页
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金:中央级公益性科研院所基本科研业务专项(1630062014010) 海南省自然科学基金项目(20153134)
主 题:香蕉(Musa nana Lour.) α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶 生物信息 基因家族 进化分析
摘 要:为了研究香蕉(Musa nana Lour.)α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶(α-1,4-glucan starch phosphorylase,PHS)基因家族的特征和功能,利用生物信息学方法对香蕉PHS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。结果表明,在香蕉中共鉴定出2个成员,Ma PHS1的开放阅读框长度为2 784 bp,编码927个氨基酸,分子质量为104.8 ku,等电点为6.59;Ma PHS2的开放阅读框长度为2 517 bp,编码838个氨基酸,分子质量为95.09 ku,等电点为6.09。Ma PHS1和Ma PHS2分别含有17个和15个外显子;Ma PHS1和Ma PHS2均含有淀粉磷酸化酶的保守性基序,进化过程中比较保守。