中科院昆明动物所等发布新款基因测序软件
出 版 物:《食品与机械》 (Food and Machinery)
年 卷 期:2016年第32卷第6期
页 面:102-102页
核心收录:
学科分类:08[工学] 0835[工学-软件工程] 081202[工学-计算机软件与理论] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)]
主 题:基因测序 合作团队 中国科学报 动物研究所 马占山 线性复杂度 叶承 测序仪 综合测试 郭爽
摘 要:中国科学报讯(记者郭爽)中科院昆明动物研究所研究员马占山与美国马里兰大学叶承曦博士在基因测序领域的合作再次取得重要突破。合作团队近日正式发布了一款代号为Sparc的软件。 针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%~40%的问题,该团队研发出了一套"线性复杂度"(复杂性最低)的算法,Sparc软件即基于该新算法完成。综合测试显示:采用测序深度仅为30x的三代基因测序数据,