棉花花药全生育期均一化全长cDNA文库的构建和分析
Construction and Analysis of Normalized Full-Length cDNA Library of Upland Cotton Anthers作者机构:中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室 西北农林科技大学农学院
出 版 物:《中国农业科学》 (Scientia Agricultura Sinica)
年 卷 期:2013年第46卷第18期
页 面:3743-3749页
核心收录:
基 金:国家高技术研究发展计划(2011AA10A102) 国家重点基础研究发展计划(2010CB126006)
摘 要:【目的】深入了解棉花花药发育的分子机制,并为其不育机理的研究提供参考序列。【方法】构建棉花花药全生育期的均一化全长cDNA文库并测序获得9 896条高质量的EST,利用生物信息学和荧光定量相结合法对所得数据进行系统分析。【结果】该cDNA文库库容为1.2×107,插入片段分布在1—3 kb。将所测得的高质量EST进行拼接得到6 643条unigenes,平均长度为779 bp。经过序列比对注释和生物信息学分析,得到一系列在棉花花药发育过程中起重要作用的基因,并获得28条参与花粉壁合成的基因。荧光定量结果表明,这些基因均在花药发育前期优势表达,尤其是在四分体时期表达量最高。【结论】获得大量的棉花花药表达基因,并分析得到一些调节棉花花药发育的重要途径以及参与棉花花粉壁合成相关基因。