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土壤微生物群落多样性解析法:从培养到非培养

Culture-dependent and culture-independent approaches to studying soil microbial diversity

作     者:刘国华 叶正芳 吴为中 LIU Guohua;YE Zhengfang;WU Weizhong

作者机构:北京大学环境工程系教育部水沙科学重点实验室北京100871 北京大学环境科学系北京100871 

出 版 物:《生态学报》 (Acta Ecologica Sinica)

年 卷 期:2012年第32卷第14期

页      面:4421-4433页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 0830[工学-环境科学与工程(可授工学、理学、农学学位)] 07[理学] 0713[理学-生态学] 

基  金:中国博士后科学基金(20110490219) 

主  题:土壤微生物多样性 生化技术 分子生物学技术 应用和进展 

摘      要:土壤微生物群落多样性是土壤微生物生态学和环境科学的重点研究内容之一。传统的土壤微生物群落多样性解析技术是指纯培养分离法(平板分离和形态分析法以及群落水平生理学指纹法)。后来,研究者们建立了多样性评价较为客观的生物标记法(磷脂脂肪酸法和呼吸醌指纹法)。随着土壤基因组提取技术和基因片段扩增(PCR)技术的发展,大量的现代分子生物学技术不断地涌现并极大地推动了土壤微生物群落多样性的研究进程。这些技术主要包括:G+C%含量、DNA复性动力学、核酸杂交法(FISH和DNA芯片技术)、土壤宏基因组学以及DNA指纹图谱技术等。综述了这些技术的基本原理、比较了各种技术的优缺点并且介绍了他们在土壤微生物群落多样性研究中的应用,展望了这些技术的发展方向。

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