人禽流感H_5N_1毒株PB1基因突变分析

作     者：黄平 俞守义 柯昌文 邹丽容 方苓 李晖 陈秋霞 HUANG Ping;YU Shou-yi;KE Chang-wen;ZOU Li-rong;FANG Ling;LI Hui;CHEN Qiu-xia

作者机构：广东省疾病预防控制中心 南方医科大学公共卫生与热带医学学院流行病学系广州510515 

出 版 物：《第三军医大学学报》 (Journal of Third Military Medical University)

年 卷 期：2007年第29卷第22期

页      面：2168-2170页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 071007[理学-遗传学] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：广东省科技项目(2004A2090102)~~ 

主　　题：人禽流感 H5N1毒株 PB1基因 突变 进化 

摘      要：目的通过对人禽流感H5N1毒株PB1基因序列的变异分析，揭示毒株PB1基因的特征与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株PB1基因核苷酸序列，同时检索全球人禽流感H5N1毒株PB1基因序列，采用DNAStarLa-sergene软件对检索的人禽流感H5N1毒株PB1基因核苷酸序列进行比对和分析，并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果将50株毒株PB1基因核苷酸序列按同源性分成两组：1997-1998年毒株为第1组（G1），2003-2006年毒株为第2组（G2）。PB1基因74个氨基酸发生位点置换，占9．78％（74/757）。PB1基因Ks值为26．1×10^-6～39．8×10～Nt/d，Ka值为3．91×10^-6～5．59×10^-6～Nt/d，检验结果显示，基因进化受到负选择性压力。2003-2006年毒株（G2）丢失G757，引起氨基酸结构改变；同时糖基化位点也较1997-1998年毒株减少了1个糖基化位点NES382-384。结论目前PB1基因进化分成两组，自发突变作用影响PB1基因进化；PB1基因与PB2基因的进化途径在时间特征和区域特征方面类似。2003-2006年毒株PB1基因氨基酸结构和糖基化位点均有改变。