多重实时荧光定量PCR检测肠出血性大肠杆菌O157:H7
Detection and identification of Escherichia coli O157:H7 by multiplex real-time PCR作者机构:浙江省疾病预防控制中心杭州310051
出 版 物:《中华微生物学和免疫学杂志》 (Chinese Journal of Microbiology and Immunology)
年 卷 期:2009年第29卷第12期
页 面:1135-1139页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 100210[医学-外科学(含:普外、骨外、泌尿外、胸心外、神外、整形、烧伤、野战外)] 10[医学]
基 金:艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项(2008ZX10004-002) 浙江省医药卫生科学研究基金(2007A037)
主 题:多重实时荧光定量PCR 肠出血性大肠杆菌O157:H7 检测 靶基因
摘 要:目的利用多重荧光定量PCR技术,建立一种快速、准确、特异检测肠出血性大肠杆菌O157:H7的定量方法。方法选取肠出血性大肠杆菌O157:H7编码脂多糖基因(rfoE)和编码鞭毛抗原基因(fliC)作为检测的靶基因,设计引物和TaqMan—MGB探针,探针的5’端分别用FAM和HEX进行荧光标记,3’端标记MGB。优化PCR扩增体系,对多重实时荧光定量PCR方法的特异性、灵敏度、重复性评价,同时进行一定数量临床样本鉴定,与常规方法进行比较。结果本研究所建立的多重实时荧光定量PCR方法可准确、特异地检测和鉴定肠出血性大肠杆菌O157:H7,能够有效甄别肠出血性大肠杆菌O157:H7与非H7菌株,其他菌株均无阳性结果;该方法的灵敏度可达到10CFU/ml;定量检测的批间和批内变异系数均小于5%;对66例临床样本进行评价,结果显示15例肠出血性大肠杆菌O157:H7阳性,2例为肠出血性大肠杆菌O157:非H7阳性,其中16例与常规培养法结果符合,符合率达到98.49%。结论本研究建立的检测肠出血性大肠杆菌O157:H7多重实时荧光定量PCR方法快速,结果准确、可靠,操作简便,为肠出血性大肠杆菌O157:H7的临床诊断、现场流行病学调查和食品安全监测提供了新的鉴定方法。