基于16S rDNA扩增子分析柑橘黄龙病植株叶片中脉内生细菌菌群

作     者：张利平 刘顺民 蒲占湑 朱莉 吕佳 ZHANG Liping;LIU Shunmin;PU Zhanxu;ZHU Li;LYU Jia

作者机构：浙江省柑橘研究所浙江台州308026 

出 版 物：《浙江农业科学》 (Journal of Zhejiang Agricultural Sciences)

年 卷 期：2025年第66卷第2期

页      面：440-444页

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：台州市项目(15ny14) 

主　　题：柑橘黄龙病 16S rDNA 内生细菌 

摘      要：文章以黄龙病菌亚洲种为样本分析柑橘黄龙病植株叶片中脉的内生细菌种群,通过对发病样本(HLB)总共24个,空白样本(HC)12个,进行16S rDNA V3-V4区扩增子测序,通过生物信息学分析得到60种有注释的微生物OTU(可认为是60种微生物),发现HC组有54种OTU,HLB组只有38种OTU,其中HC组注释到属水平的有38个属,HLB组有30个属,在HLB组中,黄龙病菌(Candidatus Liberibacter)是优势菌群,平均占比达到81.35%,而在HC组中并未发现黄龙病菌。通过t-test分析发现,发病组和健康组中的Cadidatus Liberibacter和Roseburia2个微生物的占比在属水平上具有显著差异;根据Spearman秩相关性分析发现黄龙病菌与拟杆菌属(Bacteroides)、梭形杆菌属(Fusobacterium)及罗氏菌属(Roseburia)3个属呈正相关,与鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、放线菌属(Amnibacterium)、甲基杆菌属(Methylobacterium)及Beijerinckiaceae 1174-901-12这4个属呈负相关。