2022年山东省济南市某医院DBV的全基因组测序和遗传进化研究

作     者：申园园 韦雪敏 张宇涵 张新宇 李超 宋丽 赛林涛 许一菲 SHEN Yuanyuan;WEI Xuemin;ZHANG Yuhan;ZHANG Xinyu;LI Chao;SONG Li;SAI Lintao;XU Yifei

作者机构：山东大学齐鲁医学院公共卫生学院 山东大学齐鲁医院感染性疾病科 山东大学苏州研究院 

出 版 物：《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期：2025年第41卷第1期

页      面：141-147页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家重点研发计划重点专项(项目号:2023YFC2308502),题目:老年人群新发传染病高易感性和重症化机制研究 江苏省自然科学青年基金(项目号:BK20220270),题目:新布尼亚病毒SFTSV的实时精准检测与溯源研究 

主　　题：大别班达病毒 全基因组 遗传进化 系统进化分析 

摘      要：本研究旨在探究2022年山东省济南市某医院大别班达病毒（Dabie bandavirus,DBV）的基因组特征和遗传变异规律。在山东省某医院采集6例疑似发热伴血小板减少综合征（Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS）患者的血样，提取DBV RNA并进行全基因组测序，将新获得的DBV序列与GenBank中山东省的DBV序列组成数据集；使用BioEdit进行同源性分析，识别氨基酸变异；IQ-TREE构建系统发育树，发掘潜在的重配毒株；RDP4和SimPlot筛选可能的重组事件；Datamonkey在线服务器分析选择压力。结果表明，新获得的6条DBV全基因组序列包含96个氨基酸突变，与GenBank中山东省DBV全基因组序列相比，其中15个是新发现的突变；四种DBV基因型（C1-C4）在山东省流行；本研究共鉴定出3种DBV重配类型和7个DBV重组事件；山东省DBV的四个基因在进化过程中均受到阴性选择压力影响。山东省DBV遗传多样性不断提高且进化机制复杂，需持续监测。