2018-2024年上海市人腺病毒B亚属全基因组序列特征分析

作     者：刘嘉婧 张万菊 崔晓青 张靖翊 房方皓 陈敏 滕峥 

作者机构：上海市预防医学研究院 上海市疾病预防控制中心 

出 版 物：《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期：2025年

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：上海市加强公共卫生体系建设三年行动计划(2023-2025年)优秀青年人才项目(项目号:GWVI-11.2-YQ42),题目:人腺病毒遗传多态性及感染力变化研究 上海市加强公共卫生体系建设三年行动计划(2023-2025年)(项目号:GWVI-3)题目:超大城市生物安全关键能力和公共卫生实验室网络一体化建设 

主　　题：人腺病毒B亚属 上海 全基因组序列 分子特征 

摘      要：为了解上海市人腺病毒B亚属（Human adenovirus species B,HAdV-B）基因序列及遗传进化特征，为人腺病毒（Human adenovirus,HAdV）相关疾病防控及疫苗研发提供科学依据，本研究选取了13例2018-2024年上海市HAdV-B感染病例样本进行全基因组序列测定并获得全基因组序列，利用生物信息学软件分析基因序列特征，解析HAdV-B基因突变情况及进化规律。基于主要抗原蛋白六邻体（Hexon）、五邻体（Penton）、纤维突蛋白（Fiber）基因及全基因组的进化关系树显示，13株HAdV-B中9株为HAdV-3型，4株为HAdV-7型，HAdV-3型与HAdV-7型型别内核苷酸相似度均高达99.9%。系统发育进化树显示本研究中9株HAdV-3型上海株与国内的参考毒株聚集于同一分支；4株HAdV-7型上海株与国内流行的HAdV-7d属于同一亚分支。选取代表株进行核苷酸相似度及重组分析，其中HAdV-3型与2018年北京株（MW748657）相似度最高为99.97%,HAdV-7型与2019年广州株（MT350344）相似度最高为99.95%，代表株中均未发现有明显重组现象。应对HAdV-B的进化和变异进行持续性监测研究。