嗜黏蛋白阿克曼菌分离株全基因组及生物学特性分析

作     者：赵姝涵 倪维是 孟淑敏 于鲁敏 王培坤 

作者机构：临沂大学农林科学学院 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2025年

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(32202810) 山东省高等学校大学生创新创业训练计划项目(X202310452397)共同资助 

主　　题：嗜黏蛋白阿克曼菌 全基因组 泛基因组 生物学特性 非靶代谢组学 

摘      要：为了解前期实验室分离的嗜黏蛋白阿克曼菌（Akkermansia muciniphila，AKK）基因及生物学特性，本研究分析了分离株全基因组及泛基因组、生长特性、碳源利用能力、环境氧耐受能力、体外抑菌能力及代谢产物。结果表明两分离株全长均为2.8 Mb左右，但两者平均核苷酸相似度（average nucleotide identity， ANI）为97.52%，表明两分离株属于不同亚种。菌株泛基因组基因为7 284个，核心基因195个。两分离株稳定期OD600均为1.140左右，都可以代谢95种碳源中的23种，但在耐受环境氧气能力及抑菌能力方面SDLYAKK8分离株显著高于SDLYAKK5。同时利用非靶代谢组学技术分析了两分离株在培养基中发酵代谢产物，结果表明SDLYAKK8分离株可以产生更多的γ-氨基丁酸、N-乙酰血清素等物质，而SDLYAKK5可以产生更多的泛酸、米格列醇等多种功能性代谢产物。本研究结果为两分离株后续进一步开发利用提供了数据支撑。