基于SSR标记的104份苦荞种质资源遗传多样性及群体结构分析

作     者：吴叶宁 胡昊驰 王春勇 谢锐 张永虎 温蕊 金晓蕾 

作者机构：内蒙古自治区农牧业科学院 唐山市农业科学研究院 

出 版 物：《作物杂志》 (Crops)

年 卷 期：2025年

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：高品质加工专用杂粮种质资源创制与新品种选育(2022JBGS0035) 2023年创新基金项目—区域特色优势农作物种质资源创新与新品种选育—甜荞种质资源创新及新品种选育(2023CXJJN05) 

主　　题：苦荞 SSR分子标记 种质资源 遗传多样性 群体结构 

摘      要：利用SSR分子标记，对我国104份苦荞地方种质资源进行遗传多样性及群体结构分析。结果显示，9对多态性较高的SSR引物在104份苦荞种质资源中共扩增出22个等位基因，每对引物扩增等位基因数在2～4范围内，平均每个位点为2.444个，有效等位基因数(Ne)、Shannon’s多样性指数（I）、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)平均值分别为1.820、0.629、0.058、0.401，多态性信息含量（PIC）范围为0.0096～0.6115，平均值为0.3312。通过非加权类平均聚类法（UPGMA）聚类分析，将104份苦荞种质资源分为4个组群，内蒙古苦荞、云南苦荞、贵州苦荞和四川苦荞分布相似，主要分布在Ⅲ、Ⅳ组群，说明内蒙古苦荞与云贵川苦荞亲缘关系较近，其余省份材料分布较平均，存在着较丰富的遗传多样性。通过群体结构分析及二维主坐标分析（PCoA）验证，划分的组群情况与聚类分析基本一致。本研究进一步明确了苦荞地方种间的遗传多样性和亲缘关系，筛选出17份亲缘关系单一的种质材料，为苦荞种质资源的有效利用及新品种选育提供了重要依据。