毛果杨20S蛋白酶体基因家族成员预测及生物信息学分析

作     者：张亚飞 曹丽娜 樊昊驹 严海川 刘关君 

作者机构：东北林业大学林学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2021年

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：国家级大学生创新训练项目(202010225196)资助 

主　　题：毛果杨 20S蛋白酶体 生物信息学分析 

摘      要：20S蛋白酶体是一类苏氨酸内肽酶，除了自身降解部分无序蛋白外，还可以与调节因子结合参与泛素依赖途径和非泛素依赖途径进行蛋白质的特异性降解，这对植物的正常生长至关重要。然而，关于毛果杨20S蛋白酶体基因家族成员数量及相关生物信息学分析还未见报道，本研究以拟南芥(Arabidopsis thaliana)20S蛋白酶体基因家族为参考，在毛果杨(Populus trichocarpa)中共鉴定出33个假定的20S蛋白酶体基因家族成员。生物信息学分析结果表明，该家族基因所编码蛋白大多数为碱性蛋白及亲水性蛋白，主要存在于细胞质中；蛋白序列中存在多个保守的甘氨酸残基；系统进化树将酵母(Saccharomyces cerevisiae)、拟南芥、毛果杨的20S蛋白酶体家族基因分为四个亚类；组织特异性表达分析显示大多数20S蛋白酶体基因在根和茎中高表达。该研究鉴定了其基因家族成员并进行生物信息分析，为探索毛果杨中20S蛋白酶体参与的生理过程及相应作用机制提供理论依据，同时也可为其他林木20S蛋白酶体基因家族的研究提供参考。