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基底膜相关基因对肾细胞癌预后及临床的意义

Prognostic model of renal cell carcinoma based on basement membrane-associated genes and its clinical significance

作     者:陶华平 张烨 刘修恒 Tao Huaping;Zhang Ye;Liu Xiuheng

作者机构:武汉大学人民医院泌尿外科武汉430060 

出 版 物:《国际泌尿系统杂志》 (International Journal of Urology and Nephrology)

年 卷 期:2024年第44卷第6期

页      面:1074-1079页

学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基  金:国家自然科学基金项目(81972408) 

主  题:癌,肾细胞 基底膜相关基因 预后 

摘      要:目的探讨基底膜(BM)相关基因对肾细胞癌(RCC)预后及临床的意义。方法从TCGA和ICGC数据库中下载mRNA和临床信息,进行单因素和多因素Cox回归分析和LASSO回归分析以确定RCC患者的预后基因,随后构建预测RCC预后的风险模型。根据风险评分的中位数,将RCC患者分为高风险组和低风险组,采用Kaplan-Meier分析其预后情况,并在GDSC数据库中探讨两组之间药物敏感性的差异以及临床意义。结果TCGA数据库分析确定了109个BM相关基因在RCC中存在表达差异,选择差异最显著的50个基因进行可视化处理。单因素Cox回归分析结果显示,有18个BM相关基因对RCC患者具有预后价值。进一步使用LASSO Cox回归分析构建预测RCC患者预后的特征,最终确定了15个基因,并成功构建了风险模型。高风险组的死亡人数高于低风险组(P0.001),时间依赖的受试者工作特征曲线(ROC)分析结果显示,基于BM相关基因模型预测1、3和5年生存率的曲线下面积(AUC)分别为0.722、0.696和0.700。随着肿瘤分级、T期、N期和病理分期的增加,风险评分显著提高(均P0.001)。通过STRING数据库的PPI网络确定了10个枢纽基因。通过分析GDSC数据库中的数据,发现高风险组患者对舒尼替尼、博舒替尼、顺铂、吉西他滨等药物的IC50值低于低风险组。高风险组患者对AKT抑制剂的IC50值高于低风险组。结论本研究在RCC患者中确定了BM相关基因的差异表达,构建了基于BM相关基因的模型并在RCC患者中验证了预后预测特征。此外,RCC患者的BM相关基因风险评分与常见药物敏感性具有相关性,具有重要的临床参考价值。

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