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鹅细小病毒非结构蛋白和结构蛋白的二级结构及B细胞抗原表位预测

Prediction of Secondary Structure for Non-structure and Structure Protein of Goose Parvovirus and Their Deduced Epitope on B Cell

作     者:于天飞 马波 邢明伟 靳淼 刘海暇 李俚 王君伟 Yu Tianfei;Ma Bo;Xing Mingwei;Jin Miao;Liu Hai xia;Li Li;Wang Junwei

作者机构:东北农业大学动物医学院黑龙江哈尔滨150030 

出 版 物:《中国家禽》 (China Poultry)

年 卷 期:2007年第29卷第7期

页      面:7-10页

学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基  金:黑龙江"十五"攻关项目(GB01B503202) 

主  题:鹅细小病毒 非结构蛋白 结构蛋白 二级结构 抗原表位 

摘      要:利用DNAStar软件包中的Editseq将GPV H1株非结构蛋白和结构蛋白核苷酸序列翻译成氨基酸序列,然后利用Protean软件进行氨基酸序列分析,分别预测结构蛋白和非结构蛋白的二级结构及B细胞抗原表位。结果表明,GPVH1株非结构蛋白和结构蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,其中非结构蛋白的NS2和结构蛋白的VP3含有较多的潜在的B细胞优势抗原表位。

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