2种分子标记应用于澄黄滨珊瑚群体遗传多样性研究中的可行性

作     者：田鹏 牛文涛 林荣澄 陈彬 Suharsono TIAN Peng;NIU Wen-tao;LIN Rong-cheng;CHEN Bin;Suharsono

作者机构：国家海洋局第三海洋研究所福建厦门361005 印尼科学院海洋研究中心印尼雅加达14430 

出 版 物：《应用海洋学学报》 (Journal of Applied Oceanography)

年 卷 期：2014年第33卷第1期

页      面：46-52页

学科分类：07[理学] 0713[理学-生态学] 

基　　金：国家海洋公益性行业科研专项资助项目(201105012) 国家海洋局第三海洋研究所基本科研业务费专项资金资助项目(海三科2009034) 中印尼联合海洋生态站建设资助项目(HC130702) 

主　　题：保护生物学 澄黄滨珊瑚 群体遗传 分子标记 COI ITS1+ITS2 

摘      要：利用PCR技术对澄黄滨珊瑚的2种分子标记(线粒体细胞色素氧化酶亚基1基因COI和核糖体RNA内转录间隔区基因ITS)进行测序,探讨COI序列和ITS序列在澄黄滨珊瑚(Porites lutea)群体研究中的适用性,并从中选出最适合研究澄黄滨珊瑚群体遗传多样性的分子标记.结果显示COI序列变异位点少,成对序列差异在群体内、群体间都很小,不适于澄黄滨珊瑚的群体研究;而ITS区序列个体内成对的序列差异仅为0.35%,可以作为研究澄黄滨珊瑚群体遗传多样性的分子标记;通过对ITS1、ITS2、5.8S rRNA、ITS1+ITS2及ITS区序列的比较,认为ITS1+ITS2序列是最适合研究澄黄滨珊瑚群体遗传多样性的分子标记.本研究为以后研究我国沿岸造礁石珊瑚澄黄滨珊瑚的群体遗传结构提供方法依据,从而为保护管理和恢复受损珊瑚礁生态系统提供遗传学数据支持.