信鸽新城疫病毒P/Anhui/1/09株囊膜糖蛋白基因的遗传进化及氨基酸差异性位点分析

作     者：赵磊 张训海 王旋 龚争 张怀康 陶裴裴 王栋 李尚德 ZHAO Lei,ZHANG Xun-hai,WANG Xuan,GONG Zheng, ZHANG Huai-kang,TAO Pei-pei,WANG Dong,LI Shang-de(Anhui Key Laboratory of Poultry Infectious Disease Prevention and Control,Anhui Science and Technology University,Fengyang 233100)

作者机构：安徽科技学院家禽疫病防控监测安徽省重点实验室凤阳233100 

出 版 物：《安徽农业大学学报》 (Journal of Anhui Agricultural University)

年 卷 期：2013年第40卷第1期

页      面：70-76页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家自然科学基金(30671556) 安徽省教育厅自然科学类重点项目(KJ2010A076)共同资助 

主　　题：信鸽 新城疫 遗传进化 囊膜糖蛋白差异性 

摘      要：为分析流行于信鸽群中新城疫病毒致病株P/Anhui/1/09的分子遗传特性及其囊膜糖蛋白的差异性,采用RT-PCR法扩增其F和HN基因开放阅读框(ORF),并与已公布的主要代表性毒株序列进行遗传进化分析及615个全长F基因和480个全长HN基因推导氨基酸序列比对分析,同时对P/Anhui/1/09株进行型内遗传关系分析。结果显示:P/Anhui/1/09株F和HN基因开放阅读框长度分别为1 662 bp和1 716 bp,GenBank登录号分别为JQ290284和JQ305097,其F基因与NDV05-029、PG/CH/JS/1/06、CH/98-1鸽源毒株亲缘关系最近,同源率在98.2%～99.5%,同属基因VIb亚型,但与传统疫苗株LaSota、V4、B1和Mukteswar的遗传距离较远,同源率仅在84%～86.3%。HN基因ORF进化树分支拓扑结构与F基因相似。型内遗传关系分析显示,VIb亚型可进一步为VIb1～VIb5 5个进化分支,其中我国分离株都位于VIb1和VIb4进化分支中。氨基酸序列比对及糖基化位点分析显示,P/Anhui/1/09的F蛋白裂解位点氨基酸序列为112K-R-Q-K-R-F117,与NDV强毒株分子特征相符,并发现在七肽重复区旁497位新增一个潜在N-糖基化位点,除2个基因III型日本分离株(Miyadera和MIY/51)外,所有含497位新增糖基化位点的毒株都位于VIb1分支。包含P/Anhui/1/09株在内的大部分鸽源毒株在F蛋白aa132S(融合肽区)、aa259H和HN蛋白aa3H(胞质区)、aa122R、aa347G、aa349E存在一定特征性。