基于结构和药效团特征的人类腺苷受体拮抗剂选择性比较
Comparison of the Selectivity of Human Adenosine Receptor Antagonists Based on Structure and Pharmacophore Features作者机构：北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室北京100191
出 版 物：《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)
年 卷 期：2015年第31卷第8期
页 面：1584-1596页
核心收录：
学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 0703[理学-化学] 10[医学] 0702[理学-物理学]
基 金：国家自然科学基金(21272017) 教育部博士点基金(20090001120049)资助项目~~
摘 要：腺苷受体是重要的治疗靶标,选择性腺苷受体拮抗剂具有广泛的临床应用前景.本文通过同源模建构建了腺苷A1、A2B和A3受体的结构,采用Ligand Scout 3.12软件分别构建了腺苷受体四种亚型的拮抗剂药效团模型.然后利用Schr?dinger程序中的Induced Fit Docking模块完成受体-拮抗剂结合模式的预测,并与药效团结果进行比对.结果发现,由于结合口袋部位的残基在家族间高度保守,模建得到的各个亚型受体的初始结构活性口袋部位极为相似,无法用于亚型选择性拮抗剂的识别.而腺苷受体四种亚型拮抗剂药效团的药效特征与空间排布都不同,并与以前突变实验信息相吻合.研究结果说明,结合口袋部位的优化是模建中的关键步骤,基于配体的药效团模型所包含的一系列药效特征元素如氢键受体、氢键供体、疏水基团、芳环中心,可以很好地表征受体结合部位氢键、疏水空腔的位置及其方向.本文研究结果可以为进一步的优化同源模建结果,寻找新型的人类腺苷受体选择性拮抗剂提供理论依据.
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