起始密码子区域相关序列多态性的开发及在苜蓿遗传多样性上的应用

作     者：何庆元 李正鹏 吴萍 杨红燕 王松华 

作者机构：安徽科技学院生命科学学院安徽凤阳233100 南京农业大学大豆研究所国家大豆改良中心作物遗传与种质创新国家重点实验室江苏南京210095 

出 版 物：《植物分类与资源学报》 (Plant Diversity)

年 卷 期：2013年第35卷第1期

页      面：48-54页

学科分类：090503[农学-草业科学] 0909[农学-草学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家公益性行业(农业)科研专项"绿肥作物生产与利用技术集成研究及示范"(201103005) 安徽省教育厅重点项目(KJ2011Z066) 安徽科技学院校级重点学科(AKXK20102-1)资助项目 

主　　题：遗传多样性 苜蓿 起始密码子区域相关序列多态性 

摘      要：目前广泛使用的基于 PCR 基础的分子标记多为扩增非编码区域,或是随机基因组中扩增,在 QTL定位中得到的位点一般与目标性状基因距离较远,我们开发了一个新的基于启动子序列目的基因型分子标记技术——启动子区域相关序列多态性(SCRP) ,试图使标记能够更为准确的反映不同品种的遗传基础。它利用启动子位置保守一致序列(Kozak序列) 作为其上游引物,利用内含子富含 AATT的特性,作为核心序列设计下游引物,上下游引物均为18bp,引物间通过组合配对的方式作为扩增引物对。设计了14 条上游引物和 10 条下游引物,共 140 对引物组合,对 34 个苜蓿品种进行扩增,研究了 34 个苜蓿的遗传多样性。每个 PCR 反应产生3～16个50～2 000bp 的条带,结果表明该标记简单、可靠、具有较高多态性,并且扩增区域为一种目的基因型分子标记,在种质资源研究中具有重要价值。