SCoT标记分析节瓜育种材料的遗传多样性

作     者：杜旋 田守波 张红梅 刘娜 

作者机构：上海市农业科学院设施园艺研究所上海市设施园艺技术重点实验室 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第23期

页      面：7737-7743页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：上海市农业科学院园艺研究所青年基金课题(2021-YQ-05) 上海市科技兴农项目(2021-02-08-00-12-F00765)共同资助 

主　　题：节瓜 SCoT 遗传多样性 聚类分析 

摘      要：节瓜育种材料间存在着同名异种或者异名同种的问题，为了区别种质材料间的差异，对所得节瓜材料群体进行遗传多样性分析是重要的辅助手段。通过利用前期建立并优化的适合以节瓜基因组DNA为模板进行SCoT-PCR扩增的体系，利用前期工作筛选的14条SCoT分子标记对36份节瓜材料的基因组DNA进行PCR扩增。扩增后经1.5%琼脂糖凝胶电泳，UVP成像，共得到87条谱带，其中多态性的条带占78条，多态性比例为89.77%。通过聚类分析得到36份节瓜材料的遗传相似系数介于0.59～1.00之间，说明多态性位点较多，这些节瓜材料的遗传差异较大，材料间存在着异名同种的现象。当遗传相似系数为0.80时，这些节瓜材料分成6个居群，其中JG-7、JG-9、JG-32、JG-36都各自成为一个群组，这说明JG-7、JG-9、JG-32、JG-36这4个材料对整体材料的遗传背景差异起到了重要的作用。通过对这36份节瓜材料的遗传多样分析，明确了这些材料之间的遗传差异与相似性程度，为后期的育种工作亲本选择以及基因连锁图谱的构建提供了参考。