基于网络药理学和分子对接的“黄连-黄芩-黄柏”治疗细菌性痢疾的潜在活性成分及其作用机制研究

作     者：朱志东 蔡延渠 ZHU Zhi-dong;CAI Yan-qu

作者机构：博尔纳生物科技(江门)有限公司广东江门529143 广东药科大学新药研发中心广州510006 广东省教育厅现代中药重点实验室广州510006 国家中医药管理局中药制剂实验室(三级)广州510006 

出 版 物：《抗感染药学》 (Anti-infection Pharmacy)

年 卷 期：2024年第21卷第8期

页      面：806-814页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100706[医学-药理学] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：广东省科技厅项目(编号:KTP20210273) 

主　　题：黄连 黄芩 黄柏 细菌性痢疾 网络药理学 分子对接 活性成分 作用机制 

摘      要：目的:利用网络药理学方法和分子对接技术,分析“黄连-黄芩-黄柏(简称“三黄)治疗细菌性痢疾的潜在活性成分和作用机制,为后续的新药开发研究提供依据。方法:利用中药系统药理学平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database,TCMSP)获取“三黄的活性化合物及其潜在作用靶点,再从GeneCards、CTD、TTD和drugbank等数据库获取细菌性痢疾的疾病靶点,然后确定“三黄治疗细菌性痢疾的潜在作用靶点,随后进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,以筛选出核心靶点,进而通过GO功能分析和KEGG通路富集分析筛选“三黄治疗细菌性痢疾的生物过程和相关通路,最后通过分子对接处理分析受体与配体间的亲和力。结果:借助TCMSP,共从“三黄中筛选出87个关键活性成分,而其对应的作用靶点有228个,而在相关数据库中获取到细菌性痢疾的疾病靶点共313个,通过比较分析得到交集靶点34个;通过PPI分析,又从34个交集靶点中筛选得到14个核心靶点;通过KEGG通路富集分析发现,有14条治疗细菌性痢疾的重要信号通路;利用Cytoscape软件,根据34个交集靶点和14条重要信号通路,筛选得到度值最大的前5个活性成分依次为槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱;而分子对接结果显示,肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-6(IL-6)和环氧合酶2(PTGS2)与槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱具有较好的亲和力(结合能-5 kJ/mol)。结论:槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱可能是“三黄治疗细菌性痢疾的主要潜在活性成分,而TNF、IL-6和PTGS2可能是其主要作用靶点。