基于线粒体DNA比较中国、日本与美国熊本牡蛎群体遗传多样性

作     者：宣益聪 常广秋 刘圣 林志华 薛清刚 

作者机构：浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室 浙江万里学院宁海海洋生物种业研究院 

出 版 物：《海洋科学》 (Marine Sciences)

年 卷 期：2024年

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：宁波市重点研发计划(2023Z125) 国家自然科学基金(32073010 32002428) 宁波市“泛3315”创新团队 浙江万里学院基本科研业务费(SC1032080180110) 

主　　题：熊本牡蛎 COI MNR 遗传多样性 遗传分化 

摘      要：为研究熊本牡蛎养殖群体与野生群体的遗传多样性， 采集来自中国（浙江、南通、福建、广西、广东）、日本的6个野生群体以及美国的养殖群体共188个熊本牡蛎。对每个牡蛎的细胞色素氧化酶C亚基I （COI）和线粒体非编码区（MNR）序列进行扩增并测序， 随后对其遗传多样性、遗传结构进行分析。结果表明中国的野生群体均有较高的遗传多样性， 并且在MNR序列中有更多的单倍型多样性， 而日本和美国群体则相对较少。在COI序列中， 中国5个群体间的遗传分化系数FST较小（-0.015 57～0.001 65）， 而与美、日群体间的FST要高很多（0.2）， 而美国、日本群体间的FST较低（0.008 22）。在MNR序列中表现出了基本一致的结果， 但是美、日群体间也存在较大且显著的遗传分化(FST=0.109 68)， 显示线粒体非编码区在群体遗传学研究中较大潜力。AMOVA分析以及单倍型网络图都揭示了中国群体与美、日群体间存在着遗传分化， 并且美、日群体间存在着一定的亲缘关系， 与引种历史一致。综上所述， 中国的熊本牡蛎野生群体有高水平的遗传多样性， 5个群体间也不存在遗传分化， 而日本的野生群体面临着种质资源衰退的问题， 美国的养殖群体也由于多代人工培育表现出较低的遗传多样性水平， 并且与中国群体有着明显的遗传分化。本研究为后续选择育种群体以及杂交育种群体组合提供了参考。