‘玛瑙红’樱桃胚败育果实和正常果实比较转录组分析

作     者：宋莎 江旭升 金吉林 张绿萍 张敏 

作者机构：贵州省农业科学院果树科学研究所 贵阳市农业试验中心 

出 版 物：《种子》 (Seed)

年 卷 期：2024年第10期

页      面：43-48+53页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK一般233) 

主　　题：‘玛瑙红’樱桃 胚败育 差异表达基因 转录组测序 

摘      要：为探索‘玛瑙红’樱桃在胚败育情况下果实仍正常发育的分子机理，本研究采用Illumina高通量测序技术，对不同发育时期的‘玛瑙红’樱桃胚败育果实和正常果实样品进行转录组测序及相关分析。结果共获得98.87%的Clean Reads, 86.24%的Mapped Reads, Q3094.21%;共筛选出43 673个差异表达基因，其中所有样品组合共有的差异表达基因为8 213个，大多分布在FPKM 0～0.01区间。富集分析显示，注释到GO的差异表达基因参与分子功能、细胞组分、生物过程等，其中参与生物过程的最多；注释到KEGG通路的差异表达基因分别参与环境信息处理、生物体系统、遗传信息处理、细胞过程和新陈代谢五大通路的18个分支，大多注释到新陈代谢通路；预测为转录因子的差异表达基因共2 002个，共注释到53个转录因子家族，其中ERF家族最多。研究表明，‘玛瑙红’樱桃胚败育果实与正常发育果实在膨大期基因表达差异较大，果实转色期至果实成熟基因表达差异逐渐变小，这可能是胚败育果实正常成熟的原因。