辣椒PIN基因家族鉴定及其在果柄离区和根系发育中的表达分析

作     者：何磊 严希 赖卫 刘崇政 杨红 何建文 

作者机构：贵州省农业科学院辣椒研究所 

出 版 物：《西北植物学报》 (Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica)

年 卷 期：2024年

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：贵州省省级科技计划项目(黔科合基础-ZK 一般220) 贵州省省级科技计划项目(黔科合平台人才6018-2) 贵州省山地农业关键核心技术攻关项目(GZNYGJHX-2023008) 贵州省农业科学院项目(黔农科院青年基金21号) 

主　　题：辣椒 果柄 PIN基因家族 生物信息学 表达分析 

摘      要：【目的】鉴定和分析辣椒PIN基因家族成员的特征及其在果柄离区和根系发育中的表达情况,为解析Ca PINs功能及辣椒新品种培育提供候选基因。【方法】通过辣椒全基因组筛选鉴定PIN基因,并开展生物信息学分析,对这些基因在果柄离区和根系发育中进行表达分析。【结果】在辣椒基因组中鉴定出9个PIN基因家族成员,命名为Ca PIN1-Ca PIN9,分布于7条染色体上,Ca PIN9未锚定。Ca PIN s蛋白的氨基酸数为358～654 aa,分子质量为39 251.05～71 170.91 D,等电点为6.40～9.38,且多数成员为稳定蛋白。Ca PINs成员间具有明显的共线性,与番茄具有较近的遗传关系。Ca PINs基因包含大量生长、环境及激素响应元件。转录组数据分析表明辣椒Ca PINs的表达具有组织特异性。荧光定量PCR结果显示,Ca PINs在不同果柄离区和根系发育中有不同程度表达。【结论】辣椒Ca PINs特异性参与果柄离区形成与根系生长发育,可作为辣椒易脱柄品种培育和根系遗传改良的重要候选基因。