蓝莓醛脱氢酶超家族成员的鉴定及表达分析
作者机构:天津农学院园艺园林学院 广西民族大学化学化工学院
出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)
年 卷 期:2024年
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金:国家自然科学基金面上项目(61971312) 天津市高等学校学科领军人才 天津市创新类领军人才引进专项共同资助
主 题:蓝莓 醛脱氢酶(ALDH) 非生物胁迫 表达模式 生物信息学分析
摘 要:醛脱氢酶(aldehyde dehydrogenases, ALDH)是消除植物体内过量醛类物质的关键因子,对提高植物的抗逆性至关重要。为了进一步研究蓝莓ALDH基因家族的特点,本研究利用生物信息学对蓝莓ALDH超基因家族成员进行鉴定及理化性质分析,共筛选到40个ALDH基因,可分为8个亚家族,家族成员的氨基酸数量为385~1 038个,理论等电点为5.41~9.17,亚细胞定位预测VcALDHs蛋白主要分布在线粒体、叶绿体及细胞质。基因结构分析显示,VcALDHs的外显子数量为5~23,顺式作用元件分析表明,该家族启动子序列包括大量与生长发育、逆境胁迫、光响应和激素响应相关的元件。组织特异性分析显示,VcALDHs在不同组织部位的表达水平存在差异,以下调表达为主。利用qRT-PCR技术分析部分基因在非生物胁迫下的表达模式,结果表明VcALDH10A2和VcALDH18B5在盐、干旱和ABA胁迫下均上调表达,推测这2个基因在蓝莓非生物胁迫下发挥着重要的功能。本研究为进一步探究蓝莓VcALDHs的功能提供实验依据。