中华鳖血液细胞的分层鉴定与转录组比较分析

作     者：陈静怡 屈彦福 

作者机构：南京师范大学生命科学学院 

出 版 物：《动物学杂志》 (Chinese Journal of Zoology)

年 卷 期：2024年第5期

页      面：729-742页

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

主　　题：中华鳖 血液细胞 细胞分离 转录组学 

摘      要：本研究以中华鳖（Pelodiscus sinensis）为研究对象，利用Percoll分离法，成功从Percoll分离液不同密度层（浓度大于60%、20%～40%和50%～60%）中分别获得血液红细胞、淋巴细胞和血栓细胞。本研究对中华鳖血液细胞类型进行了更精确的鉴别和描述，并展示这3种类型细胞的转录组中重要标记基因的表达。转录组结果显示，淋巴细胞与红细胞间、血栓细胞与红细胞间以及血栓细胞与淋巴细胞间，分别筛选出1701、1570和1280个差异表达基因。GO富集分析显示，红细胞上调基因具有溶菌酶活性和转移酶活性，参与活性氧代谢过程的调控；淋巴细胞上调差异基因与细胞因子活性有关，参与免疫反应调节细胞表面受体信号过程和对病毒的响应；血栓细胞差异基因主要参与髓样白细胞活化、粒细胞激活和防御反应。KEGG富集分析显示，淋巴细胞与红细胞的差异基因富集到NF-κB信号、EB病毒感染、T细胞受体信号等通路；血栓细胞与红细胞的差异基因富集到血小板激活和造血细胞谱系等；淋巴细胞和血栓细胞的差异基因富集于IL-17信号通路、病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体的相互作用等过程。同时，血液分层转录组的聚类分析结果为中华鳖血液红细胞、淋巴细胞和血栓细胞提供了潜在标记基因。