基于mRNA高通量测序初探雷帕霉素联合鞭毛蛋白体外抑制4T1乳腺癌细胞的机制
Mechanism of rapamycin combined with flagellin inhibiting 4T1 breast cancer cells in vitro based on mRNA high-throughput sequencing作者机构:贵阳市第二人民医院贵州贵阳550000 贵州医科大学附属医院临床医学研究中心贵州贵阳550000 贵州医科大学贵州贵阳550000
出 版 物:《中国病理生理杂志》 (Chinese Journal of Pathophysiology)
年 卷 期:2024年第40卷第9期
页 面:1629-1634页
核心收录:
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100214[医学-肿瘤学] 100104[医学-病理学与病理生理学] 10[医学]
基 金:贵州省科学技术厅项目(黔科合基础〔2019〕1004号) 贵阳市科技计划项目(筑科合同〔2019〕9-9-2号)
主 题:mRNA高通量测序 4T1乳腺癌细胞 雷帕霉素 鞭毛蛋白
摘 要:目的:利用mRNA高通量测序初步探讨雷帕霉素(Rapa)联合鞭毛蛋白(FliC)体外抑制4T1乳腺癌细胞的机制。方法:将4T1乳腺癌细胞分为对照(control)组、Rapa组、FliC组、Rapa+FliC组等4组,CCK-8法与流式细胞术检测细胞活力、凋亡的变化情况。同时,通过mRNA高通量测序,对差异表达基因(DEGs)进行KEGG通路分析;此外,通过STRING分析Rapa+FliC组与Rapa组两组间的DEGs,构建DEGs的蛋白相互作用(PPI)网络、筛选Hub基因。结果:CCK-8和流式细胞术检测结果显示,Rapa+FliC对4T1乳腺癌细胞的活力抑制率和凋亡率都显著高于Rapa和FliC(P0.05)。转录组测序结果显示,Rapa组和control组之间共有579个DEGs,主要富集于PI3K/Akt等信号通路;FliC组和control组之间的DEGs主要富集于Nod样受体等信号通路;Rapa+FliC组与Rapa组之间共有150个DEGs,主要富集于mTOR等信号通路。从PPI网络中,成功筛选出Atm、Itga2等10个Hub基因。结论:Rapa+FliC可能通过PI3K/Akt/mTOR信号通路,在体外抑制4T1乳腺癌细胞活力,促进细胞凋亡;Atm和Itga2基因可能是两者联合作用的关键基因。