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2019-2021年深圳市疑似病毒性腹泻门诊病例诺如病毒感染特征

作     者:吴延杰 叶郁辉 张海龙 申红卫 

作者机构:北京大学深圳医院预防保健与医院感染管理部 深圳市疾病预防控制中心 南方医科大学深圳医院检验科 

出 版 物:《热带医学杂志》 (Journal of Tropical Medicine)

年 卷 期:2024年第9期

页      面:1307-1311+1321页

学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基  金:“十三五”国家科技重大专项(2018ZX10713001) 深圳市科技计划项目(JCYJ20210324130215038,JCYJ20160428172437446) 

主  题:病毒性腹泻 门诊病例 诺如病毒 

摘      要:目的 了解2019-2021年深圳市疑似病毒性腹泻门诊病例诺如病毒(NoV)的感染特征,为深圳市NoV的预防控制提供科学依据。方法 收集2019年1月-2021年12月深圳市病毒性腹泻监测平台上送的门诊疑似病毒性腹泻患者的粪便样品2 494份,采用诺如病毒(GI、GII型)双重核酸检测试剂盒检测NoV核酸,实时荧光PCR阳性样品进一步用特异性引物扩增后测序,并通过NoV在线分型网站进行基因分型,同时并对其流行病学资料进行统计分析。结果 2019-2021年深圳市NoV总体检出率为19.93%(497/2 494),各年检出率分别为22.50%、17.55%、18.90%。男性NoV检出率为21.12%(297/1 406),女性检出率为18.38%(200/1 088),男女NoV检出率差异无统计学意义(χ2=2.889,P0.05)。15~20岁组检出率最高,为31.25%(25/80),其余依次为1~5岁组23.47%(134/571)、≥20岁组23.15%(254/1 097)、5~15岁组19.05%(28/147)、6月龄~1岁组14.55%(40/275)和0~6月龄组4.94%(16/324)。2019年NoV无明显的感染高峰,2020、2021年NoV均在秋冬季形成感染高峰。2019、2021年分别有11、10份样品为NoV混合其他腹泻病毒感染。双重核酸检测结果显示,2019-2021年NoV均以GII型检出最多,分别占77.78%、79.31%、81.82%;少量为GI型和GII型的混合感染。进一步的基因分型结果显示,497份样品中共有420份样品获得测序分型结果,总计分型项数为435份,GII.4型为本地区门诊病例NoV的最主要流行株(48.97%,213/435),其次为GII.2型(12.41%,54/435)和GII.17型(9.43%,41/435),此外有GI.5型、GII.3型等15种基因型各有1~25份不等数量的检出。结论 深圳市疑似病毒性腹泻门诊病例NoV仍然维持较高的感染水平,且其在人群中感染的型别繁多,存在持续造成聚集性暴发的风险,应继续持续加强对NoV的监测工作。

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