茄子绿果基因的精细定位及其KASP标记开发

作     者：夏志磊 俞冰昕 杨梦 连子林 官利兰 何艺超 颜爽爽 曹必好 邱正坤 

作者机构：华南农业大学园艺学院农业农村部华南地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 广东省恩平市农业技术推广服务中心 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2024年第9期

页      面：2008-2018页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：广东省基础与应用基础研究基金项目(2023A1515030070,2022A1515010734) 广东省重点研发计划项目(2022B020208003) 广东省种业振兴项目(2022-NPY-00-026) 广东省现代农业产业技术果菜产业体系创新团队项目(2023KJ110) 海南省重点研发项目(ZDYF2023XDNY041) 

主　　题：茄子 果实颜色 基因定位 KASP标记 绿果基因 APRR2 

摘      要：以白茄高代自交系E802与绿茄高代自交系NY为亲本构建的F2群体为试验材料，对茄子果色基因进行遗传连锁分析。结果显示，在304株F2群体中绿茄与白茄单株数符合3︰1孟德尔单基因分离比，其F1植株果实为绿色，表明绿茄对白茄为显性，受一个主效基因控制。以F2及其F2:3家系为材料，采用BSA-seq结合KASP分子标记连锁分析，将绿茄基因精细定位于8号染色体末端约683.4kb的范围内，其遗传距离约为0.17cM。根据茄子基因组注释信息，该区间内含有46个基因。结合序列分析、同源分析将SmAPRR2作为绿茄关键候选基因。SmAPRR2在白茄E802中存在5.27kb的大片段缺失，使其缺失第7～11号外显子，导致其功能缺失。进一步开发了与SmAPRR2紧密连锁的KASP分子标记22QP296，其在F2分离群体中的基因型和表型一致率为100%，在194份茄子自然材料中基因型和表型一致率为94.85%，可作为茄子果色分子育种的分子标记。