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基于生物信息学方法设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗

作     者:刘意 张喜悦 李昕 向祝 郎雨辰 宋时萍 赵格 曲志娜 刘立恒 王君玮 

作者机构:中国动物卫生与流行病学中心致病微生物监测室 农业农村部畜禽产品质量安全风险评估实验室(青岛) 江西农业大学动物科学技术学院 

出 版 物:《黑龙江畜牧兽医》 (Heilongjiang Animal Science and Veterinary Medicine)

年 卷 期:2024年第18期

页      面:104-109+116+135-136页

学科分类:090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基  金:“十四五”国家重点研发计划项目“牛奶安全主要风险因子评估与预警防控关键技术”(2022YFD1301003) 

主  题:沙门氏菌 生物信息学 OmpC FliC 表位 疫苗 

摘      要:为了设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗,试验在NCBI网站的Protein数据库中获取OmpC和FliC蛋白的氨基酸序列,采用Expasy服务器分析其理化性质,通过在线工具AllerTopV.2.0和Vexijen分析其抗原性和致敏性,应用NPS@服务器分析二级结构,应用IEDB在线工具分析OmpC和FliC的B、T细胞表位。选取优势表位设计鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗,对其理化性质、抗原性、致敏性及三级结构进行预测。结果表明:OmpC和FliC均是亲水性蛋白,无致敏性,抗原性较高;OmpC和FliC蛋白均筛选出3个B细胞优势表位,2个细胞毒性T细胞(CTL细胞)优势表位,1个辅助T细胞(Th细胞)优势表位。设计的多表位疫苗为亲水性的稳定蛋白,抗原性预测的分数为1.142 2分,且为非致敏原,预测三级结构模型的可信度大。说明鼠伤寒沙门氏菌OmpC-FliC多表位疫苗对动物无致敏性,且具有良好的抗原性。

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