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基于线粒体Cyt b及COⅠ基因的黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogobio nasutus )遗传多样性与系统发育关系分析

作     者:王彩雯 穆爱娟 王吉祥 王永杰 刘彦斌 刘凯 肖伟 连总强 刘哲 

作者机构:甘肃农业大学动物科学技术学院 贺兰县农业农村局 喀什大学生命与地理科学学院 宁夏回族自治区水产研究所 宁夏渔业工程技术研究中心 

出 版 物:《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期:2024年

学科分类:0908[农学-水产] 09[农学] 

基  金:宁夏重点研发计划项目(2023BCF01013) 农业农村部财政专项“黄河渔业资源与环境调查”(HHDC-2022-02)共同资助 

主  题:大鼻吻鮈 Cyt b COⅠ 遗传多样性 

摘      要:为研究黄河上游不同群体大鼻吻鮈遗传结构与系统发育关系,保护其野生种质资源,本研究基于线粒体Cyt b和COⅠ基因对黄河宁夏段及内蒙古段4个地理群体的大鼻吻鮈进行了遗传多样性及系统发育关系分析。结果表明,Cyt b和COⅠ基因序列长度分别为1 145 bp、749 bp,两个序列串联后的组合序列长度为1 894 bp,碱基组成均呈现明显的AT偏向性。4个地理种群中,线粒体Cyt b和COⅠ序列具有8个组合多态位点及9个组合单倍型,平均单倍型多样性(Hd)0.776,平均核苷酸多样性(π)0.000 78。AMOVA分析显示4个地理种群间无显著遗传分化,其中95.81%变异来自群体内部,4.18%变异来自群体间。系统发育树及单倍型网络图表明大鼻吻鮈遗传结构比较单一,错配分布结果表明大鼻吻鮈在历史上出现过群体扩张事件。综上所述,黄河中上游的大鼻吻鮈群体遗传结构单一、遗传多样性较低,有必要将其作为一个整体进行就地保护,以期丰富大鼻吻鮈种群的遗传多样性。

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