HLA-DPB1基因第2和第3外显子测序方法的建立及其多态性分析
Establishment of a polymerase chain reaction sequencing-based typing method for ttLA-DPBI exons 2 and 3 and investigation of their polymorphisms作者机构:浙江省血液中心卫生部血液安全研究重点实验室杭州310006
出 版 物:《中华医学遗传学杂志》 (Chinese Journal of Medical Genetics)
年 卷 期:2015年第32卷第1期
页 面:40-43页
核心收录:
学科分类:0831[工学-生物医学工程(可授工学、理学、医学学位)] 0710[理学-生物学] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 08[工学]
基 金:浙江省医药卫生科学研究基金(2012KYA061、2013RCB003、2013ZDA007) 浙江省白然科学基金(LY14H100001)
主 题:HLA-DPB1基因 第3外显子 多态性 造血干细胞移植
摘 要:目的建立HLA-DPB1基因第2~3外显子测序方法,并分析其多态性。方法根据HLA-DPB1基因序列,设计位点特异性引物扩增242名浙江汉族人群HLA-DPB1第2~3外显子序列,PCR扩增产物经双酶切后对第2和3外显子进行双向测序分析,采用Assign3.5+SBT分析软件判读HLA-DPB1等位基因型。结果PCR扩增获得特异性的单一目的片段,其产物经直接测序后得到清晰的序列图。242名浙江汉族人群中共检测到18个HLADPB1等位基因,频率超过0.05的等位基因为DPB1*05:01:01/135:0l(0.4112)、DPB1*02:01:02(0.1901)、DPB1*04:01:01(0.1136)以及DPB1*02:02(0.0620),并确认1个新等位基因DPB1*168:01。在第3外显子中发现9个多态性位点,其中517A〉T为本实验新检出的1个多态性位点。结论本实验建立的HLA~DPB1第2~3外显子测序方法是可行的,HLA-DPB1第3外显子存在一定多态性。