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单链构象多态性技术在微生物群落动态监测中的应用

Application of Single-Strand Conformation Polymorphism(SSCP) Technique in Microbial Community Dynamics Monitoring

作     者:赵阳国 任南琪 王爱杰 刘广民 王旭 

作者机构:哈尔滨工业大学市政环境工程学院黑龙江哈尔滨150090 

出 版 物:《生物技术》 (Biotechnology)

年 卷 期:2005年第15卷第1期

页      面:87-89页

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基  金:国家高技术研发 (863)计划引导项目 (2 0 0 2AA0 0 1 0 36) 国家自然科学基金项目 (50 2 0 80 0 6) 

主  题:单链构象多态性 微生物群落 动态监测 

摘      要:详述了单链构象多态性技术实现的基本过程和关键步骤 ,以及在微生物群落结构和动态分析中的应用。还针对SSCP技术存在的问题 ,根据实践经验提出了一些改进建议 ,认为在进行复杂微生物群落分析时 ,应采用低pH值 (pH7.7)的TBE电泳缓冲液 ,并以λ核酸外切酶将PCR产物中的反意义链去掉 ,从而减少大量非特异的异源双链带的出现 ,提高技术的分辨率。采用该技术能够很好地监测到群落中优势种群的动态变化 。

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