基于基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术的快速沙门菌血清型分型

作     者：王鲁彦 侯心娇 孙慧颖 刁保卫 李杰 闫梅英 Wang Luyan;Hou Xinjiao;Sun Huiying;Diao Baowei;Li Jie;Yan Meiying

作者机构：山东省阳信县疾病预防控制中心滨州251800 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206 山东大学公共卫生学院济南250061 

出 版 物：《中华流行病学杂志》 (Chinese Journal of Epidemiology)

年 卷 期：2024年第45卷第9期

页      面：1266-1272页

核心收录：

学科分类：1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 10[医学] 

基　　金：基于质谱法的沙门菌分型研究(KFYJ-2021-009) 主要沙门菌血清型荧光PCR鉴定技术(KFYJ-2021-027) 

主　　题：基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 血清分型 沙门菌 

摘      要：目的应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对常见沙门菌血清型进行鉴定,为临床早期精确治疗提供病原学依据。方法收集不同地区来源的500株菌株,采用血清凝集及基因组测序方法确定5种临床常见的沙门菌(包括伤寒沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌、印第安纳沙门菌)血清型,提取菌株的蛋白复合物,进行图谱采集,构建肽指纹图谱数据库,利用不同模块算法建立沙门菌血清分型方法,然后用155株测试菌株评价该分型方法的准确性。结果建立了5种沙门菌血清型MALDI-TOF MS数据库,在此基础上建立基于匹配算法和基于神经元卷积网络机器学习方法的2种沙门菌血清型分型方法,通过测试菌株分别评价2种分型方法的鉴定效果,发现基于匹配算法的MALDI-TOF MS能够快速识别、鉴定5种临床常见的沙门菌血清型,对沙门菌血清型鉴定的准确率可达100.00%,分型的敏感性及特异性均达100.00%。而且,该分型方法用时短(15~20 min)、重复性好。而基于机器学习的方法不能准确区分不同的血清型,分型的敏感性及特异性分别为82.23%和95.81%。结论本研究建立的基于MALDI-TOF MS技术的沙门菌血清分型方法能够简便、快速、准确地进行临床常见沙门菌血清分型。