基于SSR分子标记的枣品种鉴定及DNA分子身份证构建

作     者：包文慧 包杭盖 武阳 路东晔 张玉平 白玉娥 潘青华 BAO Wenhui;BAO Hanggai;WU Yang;LU Dongye;ZHANG Yuping;BAI Yu’e;PAN Qinghua

作者机构：北京市农林科学院林业果树研究所北京100093 内蒙古农业大学林学院内蒙古呼和浩特010019 农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室北京100093 北京市落叶果树工程技术研究中心北京100093 农业农村部华北都市农业重点实验室北京100093 

出 版 物：《中南林业科技大学学报》 (Journal of Central South University of Forestry & Technology)

年 卷 期：2024年第44卷第6期

页      面：175-185页

核心收录：

学科分类：090702[农学-森林培育] 0907[农学-林学] 09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：内蒙古自治区科技重大专项(2021ZD0041) 北京市农林科学院创新能力建设专项(KJCX20240102,KJCX20230118) 

主　　题：枣 SSR分子标记 遗传多样性 DNA分子身份证 

摘      要：【目的】利用荧光SSR分子标记对北京枣主栽品种的亲缘关系及遗传多样性分析并构建枣品种DNA分子身份证,为枣新品种选育、生产利用奠定基础。【方法】收集103个枣品种材料,筛选SSR荧光标记引物,采用多重荧光毛细管电泳检测技术分析扩增条带分子量和等位基因,获得相应的扩增带型,从而对每个枣种质材料进行标记并构建供试样品的DNA分子身份证。【结果】基于SSR分子标记技术,筛选出19对SSR引物用于103个枣品种遗传多样性分析,并筛选了7对核心基因组合构建DNA分子身份证。结果表明:19对引物对103个枣品种样品经SSR-PCR扩增后共检测到了156个等位标记点,每对引物平均8.211个,有效等位基因(Ne)变化范围为1.263~12.568,平均为3.467;Shannon’s信息指数(I)分布范围0.547~2.664,平均为1.351;多态信息含量PIC值变幅在0.32~0.917,平均值为0.603,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)范围分别为0.208~0.920和0.133~0.990,Ho和He的平均值为0.639和0.637,显示出有较高的杂合度;遗传相似系数为0.85~0.98,且在相似系数为0.85处时被分为两大类。【结论】北京地区京枣31和京枣311、马牙枣和牙枣等栽培品种的遗传背景较狭窄,遗传相似度较高,不同品系间基因交流较少;京枣60、朗家园枣、北京蜂蜜罐、北京泡泡枣、京枣28等枣的亲缘关系较远,遗传多样性丰富。本研究结果为枣品种鉴定和培育新品种提供了重要依据。