环境病原微生物研究数据库及数据挖掘方法

作     者：王尚 冯凯 李瞳 王洁 顾松松 杨兴盛 李春格 邓晔 

作者机构：中国科学院生态环境研究中心中国科学院环境生物技术重点实验室 中国科学院大学 中国地质大学(北京)中国地质大学生物地质与环境地质国家重点实验室 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2024年

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 083002[工学-环境工程] 100705[医学-微生物与生化药学] 0830[工学-环境科学与工程（可授工学、理学、农学学位）] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 08[工学] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 0713[理学-生态学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2022YFC3204703) 国家自然科学基金项目(42277104) 

主　　题：环境生物安全 大数据 病原微生物 全球变化 环境健康风险 

摘      要：环境生物安全与社会稳定、人类健康及国防安全等多个关键领域密切相关。鉴于气候变化以及人类活动对生态系统不断加大的压力，未知病原体从环境中溢出的风险显著增加。当前的研究方法多集中于已知病原体的检测与分析，然而，组学技术及其相关生物信息学技术的快速发展与应用，为识别未知环境病原体及预警潜在的环境健康风险提供了新的机遇与解决方案。这些技术的发展不仅促进了对微生物与动物、人类以及环境之间相互作用关系的理解，更是实现“同一健康（One Health）理念的重要组成部分。本文简述了全球变化对环境病原体逸出的影响及其引发的健康风险，从数据存储、数据分析到数据挖掘三个维度对生物信息学在环境病原体研究中的应用与进展进行了深入探讨，对当前领域内存在的问题进行了剖析，并对未来利用大数据进行环境病原体检测与风险评估的应用前景进行了展望。