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新生儿常见感染病原菌的16SrDNA寡核苷酸阵列快速诊断

Rapid diagnosis of common pathogenic bacteria infection in newborn infants by 16SrDNA oligonucleotide array

作     者:沈德新 杜江 封志纯 SHEN De-xin;DU Jiang;FENG Zhi-chun

作者机构:广州市第一军医大学珠江医院儿科510282 

出 版 物:《中华儿科杂志》 (Chinese Journal of Pediatrics)

年 卷 期:2004年第42卷第9期

页      面:668-672页

核心收录:

学科分类:1002[医学-临床医学] 100202[医学-儿科学] 10[医学] 

基  金:广州市科委科技攻关基金资助项目 (JB0 2 2 0 0 0 Z 0 0 1 0 1) 

主  题:常见 寡核苷酸 快速诊断 病原菌 通用引物 病原细菌 新生儿感染 杂交 变异 PCR产物 

摘      要:目的 探讨PCR结合寡核苷酸阵列杂交快速诊断常见新生儿感染病原细菌方法。方法 通过对 4 0多种常见病原菌的 16SrDNA序列比较分析 ,在中间找到一段两端高度保守中间相对变异的序列。依据其保守序列设计一对通用引物 ,用于扩增细菌 16SrDNA目的基因。同时依据相对变异区域的序列设计常见的 8种病原细菌的探针 ,阵列于带正电的尼龙膜上 ,与通用引物的PCR产物杂交 ,在一个反应体系中 1次可检测出标本中可能存在的常见致病菌。结果 设计的通用引物能有效扩增出常见的细菌目的序列。实验结果表明寡核苷酸阵列均能特异地与其检测细菌的通用引物PCR产物杂交 ,而不与其它所试细菌通用引物PCR产物杂交 ,说明探针具有很强的特异性。进一步采用寡核苷酸阵列对临床分离的菌株进行鉴定 ,以细菌自动鉴定仪做对比 ,结果表明寡核苷酸阵列能检出常见的 8种病原菌。

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