绵羊EDA和EDAR基因InDel检测及其与生长发育性状的关联分析

作     者：陈梦柯 参丹 白俊艳 王玉琴 卢小宁 何豫涵 曾凡林 杨旭光 梁任杰 

作者机构：河南科技大学动物科技学院 内蒙古赤峰市宁城县三座店镇政府 洛阳市动物遗传育种重点实验室 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2024年

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目 

主　　题：绵羊 EDA InDel 生长发育性状 关联分析 

摘      要：本研究旨在分析绵羊外胚叶发育不全基因（Ectodysplasin A，EDA）及其受体基因EDAR与生长发育性状的关系，以湖羊、杜泊羊和小尾寒羊为研究对象，利用NCBI数据库对EDA基因和EDAR基因的插入/缺失（Insertion/Deletion，InDel）位点进行筛选，通过PCR扩增等技术检测出InDel位点的基因型并进行统计，将不同位点的基因型与3个品种绵羊的生长发育性状进行关联分析。结果表明：共检测到4个InDel位点，分别是EDA-5、EDA-7、EDA-8和EDAR-4，这4个位点分别包含共3种基因型（II、ID和DD）。杜泊羊的3个InDel位点（EDA-5、EDA-7和EDA-8）中I等位基因均为优势等位基因，湖羊群体的3个位点（EDA-5、EDA-7和EDA-8）的ID基因型的体高、背高、臀端高、体长、胸围、胸宽、胸深和管围都显著高于II和DD基因型，而EDAR-4位点的II基因型个体均表现出更好的生产性状表型值；杜泊羊的EDA-5、EDA-8和EDAR-4分别与体高、背高、体斜长、胸宽、胸深、管围、腰角宽和臀端宽显著相关，EDA-5和EDA-8位点DD基因型个体具有较好的体高、背高、体斜长、胸宽、管围和臀端高表型值，而EDAR-4位点的II基因型个体有较高的胸深、管围、腰角宽和臀端款表型值；小尾寒羊的EDA-7位点II和DD基因型的体高、腿臀围显著高于ID基因型，而EDAR-4位点ID基因型的头长显著高于II和DD基因型个体。本研究为绵羊的选种选育提供了理论依据，EDA和EDAR基因的4个InDel位点可以作为绵羊辅助遗传育种的候选分子标记。