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基于机器学习构建新型结肠癌免疫评分模型

作     者:孙学梦 闫天姿 苏丽娅 侯明星 刘芳远 

作者机构:内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心 内蒙古自治区医学细胞生物学重点实验室 内蒙古医科大学 内蒙古医科大学附属医院胃肠外科 

出 版 物:《中国免疫学杂志》 (Chinese Journal of Immunology)

年 卷 期:2024年

核心收录:

学科分类:12[管理学] 1201[管理学-管理科学与工程(可授管理学、工学学位)] 1002[医学-临床医学] 081104[工学-模式识别与智能系统] 08[工学] 100214[医学-肿瘤学] 0835[工学-软件工程] 0811[工学-控制科学与工程] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)] 10[医学] 

基  金:国家自然科学基金(81860541) 内蒙古自然科学基金面上项目(2021MS08030) 内蒙古医科大学致远人才计划(ZY0120025) 内蒙古医科大学实验室开放基金项目(2022ZN30)的支持 

主  题:免疫基因 结肠癌 机器学习 免疫治疗 TCGA 

摘      要:目的: 基于免疫相关基因,利用机器学习方法构建结肠癌免疫评分模型,用于评估患者的生存状态和免疫治疗效果。方法: 使用Lasso+bootstrap+多因素Cox的组合策略,基于1302个免疫相关基因在结肠癌中的表达情况,对来自TCGA 的结肠癌患者进行免疫相关基因(immune-related genes,IRG)评分,并对高/低分组在功能差异、预后状态、免疫治疗相关等方面进行比较。结果: 基于免疫评分得到的分组在结肠癌患者预后状态方面具有显著差异,并且通过了其他独立数据集的验证,评分模型同时能够评估结肠癌患者的免疫治疗效果。结论:我们的研究能为基于免疫基因的结肠癌免疫治疗和研究提供思路,评分模型可以用于评估结肠癌患者的预后情况。

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