咨询与建议

看过本文的还看了

相关文献

该作者的其他文献

文献详情 >基于高分辨液质联用技术与网络药理学探讨泽苓定眩汤物质基础及其... 收藏

基于高分辨液质联用技术与网络药理学探讨泽苓定眩汤物质基础及其治疗眩晕症可能机制

作     者:王讯 韩荣增 潘国涛 

作者机构:东台市中医院 

出 版 物:《河南中医》 (Henan Traditional Chinese Medicine)

年 卷 期:2024年

学科分类:1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

主  题:泽苓定眩汤 天然产物成分鉴定 网络药理学 眩晕 靶点 

摘      要:目的 基于高分辨液质联用技术和网络药理学探讨泽苓定眩汤物质基础及其治疗眩晕症的可能作用靶点和途径,同时采用传统的基于药材饮片的网络药理学预测,比较两者的异同。方法 采用Q-Orbitrap高分辨液质联用技术对苓定眩汤复方制剂进行天然产物成分鉴定,并对其进行结构进行解析。将具有3D结构的化合物使用pharmmapper数据库和Uniprot数据库进行检索,获取对应的蛋白质及靶点信息。将上述数据库所得靶点信息进行合并,从而得到基于天然产物成分鉴定所筛选出化合物所对应的靶点集合(集合A)。使用TCMSP数据库收集泽苓定眩汤组方中各药材已报道有效成分及对应靶点信息,并采用上述相同方法获取组方药材对应的已知靶点集合(集合B)。将集合A和集合B取交并集,共有55个靶点相同,采用蛋白相互作用分析数据库STRING绘制PPI网络图,利用Metascape平台对基因进行富集分析。结果 采用高分辨液质联用技术对泽苓定眩汤复方制剂进行天然产物成分鉴定,共得到582个化合物,其中与数据库比对fullmatch得分大于等于80分的化合物共计93个。将该93个筛选出的化合物在Pubchem中可检索到64个化合物的3D结构。基于天然产物筛选出的化合物所对应的靶点共计550个。将泽苓定眩汤中七味药材使用TCMSP数据库可得到157个靶点,其预测出的靶点数量明显少于基于天然产物成分鉴定所得靶点数量。其两者交并集靶点共计55个。GO功能富集分析共得到519条富集结果,其中包含55个经典通路;KEGG富集结果得到140条代谢通路。该55个靶点既具有药材已知研究数据,又在本复方制剂成分鉴定结果中筛选出,其具有非常客观的研究价值。结论泽苓定眩汤复方制剂为经过提取工艺所得制剂产品,其可以解析出的化合物为客观事实,用该化合物可得到550个靶点信息,而使用传统的仅基于药材进行的靶点预测结果十分有限,仅可得到157个靶点,而两者重合个数只有55个。两种方法取交并集所得靶点结果更加可靠,能够反应出药材经过提取工艺后客观的物质基础及其潜在的生物学功能,比单纯使用TCMSP数据库进行药材检索所得靶点更具客观性。

读者评论 与其他读者分享你的观点

用户名:未登录
我的评分