基于重测序鉴定GbTMEM214基因在陆地棉基因组的插入位点

作     者：程俊凌 赵亮 徐剑文 刘剑光 徐鹏 徐珍珍 郭琪 王月平 赵君 沈新莲 陈全家 肖松华 Cheng Junling;Zhao Liang;Xu Jianwen;Liu Jianguang;Xu Peng;Xu Zhenzhen;Guo Qi;Wang Yueping;Zhao Jun;Shen Xinlian;Chen Quanjia;Xiao Songhua

作者机构：新疆农业大学农学院/棉花教育部工程研究中心乌鲁木齐830052 江苏省农业科学院经济作物研究所/农业农村部长江下游棉花与油菜重点实验室南京210014 

出 版 物：《棉花学报》 (Cotton Science)

年 卷 期：2024年第36卷第4期

页      面：285-295页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：农业生物育种重大项目(2023ZD04039-02-04) 国家自然科学基金(31971904,31401727) 

主　　题：转基因棉花 GbTMEM214 重测序 插入位点 侧翼序列 

摘      要：【目的】利用农杆菌介导法获得了转GbTMEM214基因陆地棉品系,旨在明确转基因棉花株系中T-DNA插入位点的序列特征及检测方法,为其生物安全评价提供依据。【方法】基于基因组重测序技术,利用BLASTn将测序数据与陆地棉TM-1基因组序列进行比对分析,设计特异性引物通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)验证插入位点。【结果】携带目标基因GbTMEM214的T-DNA整合在陆地棉基因组D13号染色体57019068~57019106 bp,T-DNA插入导致受体基因组37 bp的片段缺失;通过PCR扩增获得携带GbTMEM214基因的T-DNA插入位点的侧翼序列,由此建立了转GbTMEM214基因棉花的特异性检测方法。【结论】基于基因组重测序技术获得了转GbTMEM214基因棉花的T-DNA插入位点及侧翼序列信息,可为转基因棉花的生物安全评价提供技术参考。