植物LFY基因家族的进化分析
作者机构:西南大学农学与生物科技学院 西南大学南方山地农业教育部工程研究中心 西南大学薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室 重庆市农业技术推广总站 Department of Vegetable Crops, Faculty of Agriculture, Cairo University
出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)
年 卷 期:2023年
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:国家重点研发计划项目(2018YFE0127900) 国家自然科学基金资助项目(32101659) 科技部科技伙伴计划项目(KY201904016) 重庆市级大学生创新训练项目(S202210635086) 西南大学人才引进项目(SWU019008)共同资助
摘 要:LFY (LEAFY)是开花过程中的关键基因,在花发育的各个阶段发挥作用,尤其在植物由营养生长阶段向生殖生长阶段的转变过程中起着至关重要的作用。对LFY基因家族研究可进一步理解植物开花过程。本研究以拟南芥LFY蛋白序列作为源序列,利用blastp方法获得23个物种的34个LFY基因,并对这些基因编码蛋白的基本理化性质、基因结构、蛋白结构域及进化树特点等进行了生物信息学分析。保守结构域和组织表达特征分析结果展现了LFY基因家族进化的保守性,LFY基因在马铃薯、拟南芥和水稻等物种中都与花的发育有关。LFY蛋白等电点和氨基酸显著性分析、基因结构分析和保守基序分析展现了LFY基因家族进化的变异性。单子叶植物和双子叶植物的LFY蛋白等电点和酸性氨基酸占比存在显著性差异。LFY基因在一些物种间的进化较为保守,但在单子叶植物和双子叶植物之间存在许多变异。本研究可以为LFY基因家族成员的功能研究提供一定的理论基础。