涮辣与昆明皱皮椒pAMT生物信息学及表达分析

作     者：张祥 刘雨婷 张婧柔 李平平 谢志和 赵凯 吕俊恒 张芮豪 邓明华 Zhang Xiang;Liu Yuting;Zhang Jingrou;Li Pingping;Xie Zhihe;Zhao Kai;LüJunheng;Zhang Ruihao;Deng Minghua

作者机构：云南农业大学园林园艺学院昆明650201 云南农业大学云南省高校蔬菜种业工程研究中心昆明650201 云南省通海县经济作物工作站玉溪市邓明华专家基层科研工作站通海652700 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第22卷第18期

页      面：5917-5927页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31160394 31560556) 云南省科技厅重大专项(2018BB020)共同资助 

主　　题：涮辣 昆明皱皮椒 假定的氨基转氨酶(pAMT) 生物信息学 外源物质 

摘      要：为分析涮辣与昆明皱皮椒假定的氨基转氨酶(pAMT)的差异,探究pAMT表达规律。本研究基于基因克隆和生物信息学方法分析pAMT基因和蛋白特性,利用qPCR测定pAMT相对表达量。结果显示,涮辣与昆明皱皮椒p AMT由1380个碱基组成,编码459个氨基酸残基,相比昆明皱皮椒,涮辣pAMT存在7个同义突变和5个错义突变位点。顺式作用元件预测结果显示,辣椒pAMT可能受环境和植物激素的影响。蛋白特性结果显示,pAMT蛋白属于Ⅰ型折叠,Ⅲ类转氨酶,为脂溶性、亲水性的不稳定蛋白,主要定位在细胞质中,无信号肽与跨膜结构。两种辣椒pAMT蛋白配体结合位点、活性位点和蛋白磷酸化位点存在差异,不同物种AMT在进化上有保守性,但在亚组间也存在一定差别。在不同发育阶段,pAMT表达呈现先升高后急剧降低,且露地条件下p AMT表达量高于大棚;同一环境条件下,涮辣pAMT表达量整体高于昆明皱皮椒;不同外源物质在一定时间内影响pAMT的表达。相对于昆明皱皮椒,涮辣pAMT基因和蛋白的改变,可能是涮辣辣度极高的原因,并且不同生长环境、发育阶段和外源物质可能通过调节pAMT的表达来影响辣椒中辣椒素的生物合成。