基于网络药理学及分子对接探究蒲公英治疗脓毒症急性肺损伤的作用机制
Investigating the Mechanism of Dandelion in Treating Sepsis-Induced Acute Lung Injury through Network Pharmacology and Molecular Docking作者机构:河北北方学院生命科学研究中心 河北北方学院微循环研究所 河北北方学院中医学院 河北北方学院附属第一医院 河北北方学院基础医学院
出 版 物:《实用休克杂志(中英文)》 (Journal of Practical Shock)
年 卷 期:2024年第8卷第2期
页 面:93-97页
学科分类:1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学]
基 金:河北北方学院自然科学研究面上项目(项目编号:XJ2024019)
摘 要:目的探讨蒲公英治疗脓毒症急性肺损伤的作用机制。方法通过BATMAN、HERB、TCM-ID和SYMMAP等数据库筛选蒲公英活性成分及靶点。通过CTD、GeneCards、DisGeNET、OpenTargets等数据库获得脓毒症和急性肺损伤靶点,与蒲公英靶点取交集获得蒲公英-脓毒症-急性肺损伤共同靶点。通过Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图。STRING数据库构建蛋白互作网络筛选核心靶点。Cytoscape软件构建药物-成分-靶点-通路-疾病网络。使用AutoDock对活性成分和核心靶点进行分子对接。结果共获得蒲公英有效成分9个和潜在作用靶点560个,脓毒症相关靶点867个,急性肺损伤相关靶点488个,蒲公英-脓毒症-急性肺损伤共同靶点141个。核心靶点有TP53、IL6、STAT3、TNF、JUN、AKT1、IL1B、NFKB1等。利用R软件对共同靶点进行GO和KEGG分析并可视化。共富集到178条信号通路,3189个细胞生物学过程。分子对接结果表明9个活性成分与核心靶点具有较高亲和活性。结论蒲公英可通过多成分、多靶点、多通路的特点对脓毒症急性肺损伤起到干预作用,为蒲公英在治疗脓毒症急性肺损伤中的应用及后续实验验证提供了一定的依据。