基于GEO数据库挖掘乳腺癌他莫昔芬耐药相关的糖酵解基因及其机制探讨

作     者：夏佳琳 赵卫卫 李静 XIA Jialin;ZHAO Weiwei;LI Jing

作者机构：南方医科大学检验与生物技术学院广东广州510515 上海交通大学附属第六人民医院南院上海201400 

出 版 物：《现代肿瘤医学》 (Journal of Modern Oncology)

年 卷 期：2024年第32卷第20期

页      面：3857-3863页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：上海市奉贤区科委科技发展基金项目(编号:20211609) 

主　　题：乳腺癌 他莫昔芬耐药 糖酵解 PYGL 

摘      要：目的:寻找糖酵解相关的他莫昔芬耐药(tamoxifen resistance,TamR)基因标志物,为乳腺癌(breast cancer,BC)的耐药机制提供理论依据。方法:从基因表达数据库GEO下载GSE67916,差异分析后与糖酵解相关基因集取交集,通过GSEA富集分析找到与他莫昔芬耐药相关的糖酵解基因,后续在外部独立数据集GSE125738和GSE9893对耐药基因进行验证。此外,在构建的他莫昔芬耐药细胞株中,对耐药基因使用qRT-PCR和Western blot技术在mRNA和蛋白层面进行验证,并通过CCK-8实验进一步验证耐药基因。结果:差异分析得到730个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),与糖酵解相关基因集取交集得到19个DEGs,对这19个DEGs进行GSEA富集,我们发现PYGL与他莫昔芬耐药信号通路和内分泌治疗抵抗信号通路相关。在数据集GSE125738和GSE9893验证PYGL在他莫昔芬耐药组中表达上调。在乳腺癌他莫昔芬耐药细胞株中,PYGL的mRNA水平和蛋白水平均表达上调。此外,CCK-8实验表明,降低PYGL的表达可增强MCF7-TamR对他莫昔芬的反应性。结论:糖酵解基因PYGL是潜在的乳腺癌他莫昔芬耐药基因,可能为乳腺癌治疗提供新的认识和靶向策略。