利用东乡普通野生稻染色体片段置换系定位水稻苗期耐盐性QTL

作     者：程怡冰 黄倩 韩冰 崔迪 邱先进 马小定 韩龙植 CHENG Yibing;HUANG Qian;HAN Bin;CUI Di;QIU Xianjin;MA Xiaoding;HAN Longzhi

作者机构：长江大学农学院湖北荆州434025 中国农业科学院作物科学研究所/作物基因资源与育种全国重点实验室北京100081 重庆师范大学生命科学学院重庆401331 

出 版 物：《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期：2024年第25卷第8期

页      面：1245-1253页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：科技创新2030-重大项目(2022ZD04017) 中国农业科学院科技创新工程项目 

主　　题：耐盐等级 幼苗存活率 分离群体分组分析 

摘      要：本实验室前期以东乡普通野生稻和日本晴为亲本创制了强耐盐染色体片段置换系CSSL91,本研究将其与日本晴和强耐盐种质Pokkati比较,结果显示CSSL91耐盐性与Pokkali相当。以CSSL91与日本晴构建的F2:3群体为试验材料,日本晴和CSSL91为对照,以耐盐等级和幼苗存活率为指标。结果表明2个指标均成正态分布,QTL连锁定位分析共检测到5个耐盐相关QTL,分别分布于第4、9、10号染色体上,LOD值介于2.95~3.97,表型贡献率为9.83%~18.48%;其中耐盐等级QTL-q ST4的表型贡献率最高,其定位在第4号染色体DX-C4-1~DX-S4-16标记间。分离群体分组分析法(BSA,bulked segregation analysis)分析检测到第4号染色体0~5.0 Mb区间有一个超过阈值的QTL,该区间与QTL-q ST4重合,QTL连锁分析方法和BSA方法均在第4号染色体的0~5.0 Mb区间定位到耐盐等级QTL,说明QTL-qST4是可靠的耐盐位点;耐盐等级QTL-qST4-1和幼苗存活率QTLqSSR4均定位在第4号染色体DX-C4-12和DX-C4-13标记间,LOD值分别为3.36和3.92,表型贡献率分别为13.97%和9.49%;在第9号、10号染色体还定位到两个耐盐等级QTL-qST9和QTL-qST10;其中QTL-qST4-1、QTL-qSSR4和QTL-qST10是本研究新定位的耐盐性QTL。本研究结果将为水稻耐盐性相关基因克隆和分子标记辅助改良水稻品种的耐盐性奠定基础。