hsa-miR-449a靶基因预测及生物信息学分析

作     者：刘廷彦 李梦丹 李兵 LIU Tingyan;LI Mengdan;LI Bing

作者机构：盘州仁泽医院贵州省盘州市553599 长春中医药大学 贵州大学医学院 

出 版 物：《医学理论与实践》 (The Journal of Medical Theory and Practice)

年 卷 期：2024年第37卷第17期

页      面：2889-2892,2905页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：贵州省科技计划基础研究(科学技术基金)项目(黔科合基础-ZK一般354) 贵州大学培育项目(贵大培育67号) 贵州大学引进人才科研项目[贵大人基合字(2020)47号] 

主　　题：hsa-miR-449a 生物信息学 靶基因 信号通路 

摘      要：目的:利用多种生物信息学数据库对hsa-miR-449a的靶基因及其生物学功能进行预测,为将来深入探索hsa-miR-449a的生物学功能及其对相关疾病的作用机制提供理论依据。方法:分析hsa-miR-449a在不同物种间的保守性及其在不同疾病中的表达情况;运用4个常用的在线数据库(mirDIP、TargetScan、miRDB、miRWalk)预测hsa-miR-449a的靶基因并取其交集,随后对其交集靶基因进行PPI网络构建、GO分析和KEGG Pathway分析。结果:hsa-miR-449a序列在10个物种间高度保守,并且在乳腺癌、卵巢癌、肺癌、子宫癌等疾病中表达明显增高;4个miRNA靶基因预测数据库取交集后共得到386个靶基因,它们广泛存在于染色质、突触、核浆、胞质等细胞组分中,主要参与调控RNA聚合酶Ⅱ启动子转录、细胞周期、信号转导等生物学过程,涉及P53、TGF-β、HIF-1、MAPK等信号通路,以及细胞衰老、胰岛素的分泌、甲状旁腺激素和醛固酮合成与分泌及神经系统的发育、肿瘤等疾病相关通路。结论:hsa-miR-449a广泛参与了细胞增殖与衰老等生命活动,以及癌症、心血管及神经系统疾病的发生发展过程。