一株自絮凝细菌Massilia sp.W12的多相分类鉴定及全基因组分析

作     者：高娜 陈诚 赵秀侠 方婷 崔凯 卢文轩 

作者机构：安徽省农业科学院水产研究所安徽省水产增养殖重点实验室 

出 版 物：《水生生物学报》 (Acta Hydrobiologica Sinica)

年 卷 期：2024年

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：安徽省重点研究与开发计划(2022107020008) 安徽省农业科学院青年英才计划(QNYC-202108) 国家现代农业产业技术体系专项(CARS-46)资助 

主　　题：多相分类 自絮凝 胞外多糖 PEP-CTERM蛋白质 马赛菌 

摘      要：生物絮团的功能主体是高度复杂的微生物聚集体,设计和优化复杂的微生物群落结构和活性对生物絮团性能的提升具有重要意义。研究以筛选自絮凝菌作为生物絮团系统外源强化菌株为目的,从中华草龟养殖池塘中分离纯化出一株自絮凝菌株,对其进行多相分类学鉴定确定W12菌株的分类地位,基因注释分析探讨其作为强化菌株的可行性。W12菌株与Massilia arenosa MC02T相似性最高,为96.21%, W12菌株与其亲缘关系较近的几株模式菌株的ANI值在71.61%—72.23%, dDDH值在19.6%—22.9%,远低于判别细菌新种的阈值,进一步表明W12为一株马赛菌属新种。此外,全基因组分析发现W12的自絮凝机制可能与喜树脂动胶菌相似,由胞外多糖和PEP-CTERM蛋白质共同介导,推测菌株W12通过PHB合成途径Ⅰ涉及PhaA、PhaB和PhaC三种酶来合成PHB。本研究从中华草龟养殖池塘分离到的自絮凝菌株W12是一株马赛菌属新种, W12菌株可以合成PHB,由胞外多糖和PEP-CTERM蛋白质共同介导其自絮凝,这些性能与生物絮团的形成息息相关。基因组分析对菌株的潜在应用价值进行挖掘,以期为生物絮团系统的功能强化提供候选菌株。